Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms