Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

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Length 1,014 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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