Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Stx18Q8VDS8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Stx18Q8VDS8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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