Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Vmn1r200Q8R281 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Vmn1r200Q8R281 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Vmn1r200Q8R281 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Vmn1r200Q8R281 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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