Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hoxc12Q8K5B8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Hoxc12Q8K5B8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxc12Q8K5B8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxc12Q8K5B8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxc12Q8K5B8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxc12Q8K5B8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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