Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Prpf39Q8K2Z2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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