Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ercc8Q8CFD5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ercc8Q8CFD5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ercc8Q8CFD5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ercc8Q8CFD5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ercc8Q8CFD5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ercc8Q8CFD5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ercc8Q8CFD5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ercc8Q8CFD5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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