Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms