Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms