Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BC049762Q8C601 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms