Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atg16l1Q8C0J2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atg16l1Q8C0J2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atg16l1Q8C0J2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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