Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms