Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms