Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg4bQ8BGE6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg4bQ8BGE6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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