Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mindy1Q76LS9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mindy1Q76LS9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mindy1Q76LS9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mindy1Q76LS9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms