Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvoplQ6PDF3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms