Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Nop58Q6DFW4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop58Q6DFW4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms