Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrmQ64674 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrmQ64674 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms