Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clcn1Q64347 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms