Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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