Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms