Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms