Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SkilQ60665 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SkilQ60665 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SkilQ60665 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SkilQ60665 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SkilQ60665 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SkilQ60665 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms