Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim41Q5NCC3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms