Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms