Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trp53i11Q4QQM4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trp53i11Q4QQM4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trp53i11Q4QQM4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trp53i11Q4QQM4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trp53i11Q4QQM4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trp53i11Q4QQM4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trp53i11Q4QQM4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trp53i11Q4QQM4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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