Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ulk3Q3U3Q1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ulk3Q3U3Q1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ulk3Q3U3Q1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ulk3Q3U3Q1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ulk3Q3U3Q1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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