Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms