Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms