Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms