Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme1P97371 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms