Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf1P84078 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms