Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf1P81269 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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