Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms