Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms