Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SqleP52019 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SqleP52019 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms