Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atoh1P48985 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atoh1P48985 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atoh1P48985 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atoh1P48985 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms