Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syt1P46096 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syt1P46096 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms