Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms