Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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