Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gjb1P28230 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gjb1P28230 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb1P28230 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms