Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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