Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18525 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18525 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18525 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms