Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms