Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb7P09024 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms