Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TtrP07309 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TtrP07309 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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