Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01643 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01643 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01643 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01643 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01643 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01643 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01643 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01643 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01643 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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