Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Sap30O88574 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sap30O88574 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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