Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp2O88554 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms