Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Per1O35973 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Per1O35973 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Per1O35973 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Per1O35973 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Per1O35973 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Per1O35973 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Per1O35973 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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